紫外线的杀菌原理是用特定纳米波长破坏细菌和病毒的DNA分子，使细菌和病毒无法繁殖。处理食物时，紫外线破坏的是细菌细胞，不会引起发热，不破坏营养成分。因为DNA不是微生物分子的营养成分，而人体需要的那些物质分子不会被破坏。因此不会在食物里留下致癌物，更不会引起构成食物的营养成分改变而产生不利于人体的物质。紫外线食品杀菌的优点是在不改变食物的自然风味前提下，避免了化学杀菌剂或者防腐剂的“异味”与化学残留，而且对于一些希望保持“自然状态”的食物比如果汁等饮料，紫外线杀菌属于冷杀菌，相对于热杀菌而言，紫外线杀菌无需对物料进行加热，利用其灭菌机理杀灭微生物，因而避免了食品成分加热而被破坏处理的优势。紫外线杀菌不会破坏食物的营养成分和味道，也不会产生致癌物质，绝对是安全可食用。
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